Sa miaging napulo ka tuig, ang teknolohiya sa pag-edit sa gene nga gibase sa CRISPR paspas nga milambo, ug malampuson nga gigamit sa pagtambal sa mga sakit nga genetic ug kanser sa mga pagsulay sa klinika sa tawo.Sa samang higayon, ang mga siyentista sa tibuok kalibutan kanunay nga nag-tap sa bag-ong mga bag-ong himan nga adunay potensyal sa pag-edit sa gene aron masulbad ang mga problema sa kasamtangan nga mga himan sa pag-edit sa gene ug mga desisyon.

Kaniadtong Setyembre 2021, ang koponan ni Zhang Feng nagpatik sa usa ka papel sa Science journal [1], ug nakit-an nga usa ka halapad nga mga transposter ang nag-code sa RNA nga naggiya sa nucleic acid nga mga enzyme ug ginganlan kini nga Omega system (lakip ang ISCB, ISRB, TNP8).Nakaplagan usab sa pagtuon nga ang sistema sa Omega naggamit sa usa ka seksyon sa RNA aron sa paggiya sa pagputol sa DNA dual chain, nga mao ang ωRNA.Labaw sa tanan, kini nga mga nucleic acid nga mga enzyme gamay ra, mga 30% ra sa CAS9, nga nagpasabut nga mahimo’g kini madala sa mga selyula.

Kaniadtong Oktubre 12, 2022, gipatik sa koponan ni Zhang Feng sa journal sa Kalikasan nga nag-ulohan: Structure of the Omega Nickase ISRB in Complex with ωrna ug Target DNA [2].

Gisusi pa sa pagtuon ang frozen electron microscope structure sa ISRB-ωRNA ug target DNA complex sa Omega system.

Ang ISCB mao ang katigulangan sa CAS9, ug ang ISRB mao ra ang butang sa kakulang sa HNH nucleic acid domain sa ISCB, mao nga ang gidak-on mas gamay, mga 350 lamang ka amino acid.Naghatag usab ang DNA og pundasyon alang sa dugang nga pag-uswag ug pagbag-o sa engineering.

Ang IsrB nga gigiyahan sa RNA kay miyembro sa pamilyang OMEGA nga gi-encode sa IS200/IS605 superfamily sa mga transposon.Gikan sa phylogenetic analysis ug gipaambit nga talagsaon nga mga dominyo, ang IsrB lagmit mao ang nag-una sa IscB, nga mao ang katigulangan sa Cas9.

Niadtong Mayo 2022, ang Lovely Dragon Laboratory sa Cornell University nagpatik sa usa ka papel sa journal Science [3], nga nag-analisar sa istruktura sa IscB-ωRNA ug ang mekanismo niini sa pagputol sa DNA.

Kung itandi sa IscB ug Cas9, ang IsrB kulang sa HNH nuclease domain, ang REC lobe, ug kadaghanan sa PAM sequence-interacting domains, mao nga ang IsrB mas gamay kay sa Cas9 (mga 350 lamang ka amino acids).Bisan pa, ang gamay nga gidak-on sa IsrB gibalanse sa usa ka medyo dako nga giya nga RNA (ang omega RNA niini mga 300 nt ang gitas-on).

Gisusi sa team ni Zhang Feng ang cryo-electron microscope structure sa IsrB (DtIsrB) gikan sa damp-heat anaerobic bacterium nga Desulfovirgula thermocuniculi ug ang complex niini sa ωRNA ug target DNA.Gipakita sa pag-analisar sa istruktura nga ang kinatibuk-ang istruktura sa protina sa IsrB nag-ambit sa istruktura sa backbone nga adunay protina nga Cas9.

Apan ang kalainan mao nga gigamit sa Cas9 ang REC lobe aron mapadali ang pag-ila sa target, samtang ang IsrB nagsalig sa ωRNA niini, usa ka bahin nga nagporma usa ka komplikado nga three-dimensional nga istruktura nga naglihok sama sa REC.

Aron mas masabtan ang mga pagbag-o sa istruktura sa IsrB ug Cas9 sa panahon sa ebolusyon gikan sa RuvC, gitandi sa koponan ni Zhang Feng ang target nga mga istruktura nga nagbugkos sa DNA sa RuvC (TtRuvC), IsrB, CjCas9 ug SpCas9 gikan sa Thermus thermophilus.

Ang pag-analisa sa istruktura sa IsrB ug ang ωRNA niini nagpatin-aw kung giunsa ang IsrB-ωRNA dungan nga giila ug gibuak ang target nga DNA, ug naghatag usab usa ka sukaranan alang sa dugang nga pag-uswag ug engineering sa kini nga miniaturized nuclease.Ang mga pagtandi sa ubang RNA-guided system nagpasiugda sa functional interaksyon tali sa mga protina ug RNAs, nga nagpauswag sa atong pagsabot sa biology ug ebolusyon niining lain-laing sistema.

Mga link:

1.https://www.science.org/doi/10.1126/science.abj6856

2.https://www.science.org/doi/10.1126/science.abq7220

3.https://www.nature.com/articles/s41586-022-05324-6