• facebook
  • linkedin
  • youtube

Human pormal nga gisugyot sa Amerikanong eskolar nga si Eric S. Lander ang single nucleotide polymorphism (SNP) isip ikatulo nga henerasyon nga molecular marker niadtong 1996, kaylap nga gigamit ang SNP sa pagtuki sa asosasyon sa ekonomikanhong kinaiya, biological genetic linkage map construction, ug human pathogenic gene screening., Pagdayagnos ug panagna sa risgo sa sakit, indibidwal nga pagsusi sa tambal, ug uban pang natad sa biolohikal ug medikal nga panukiduki.Sa natad sa pagpasanay sa cash crop, ang pagkakita sa SNP makaamgo sa sayo nga pagpili sa gikinahanglan nga mga kinaiya.Kini nga pagpili adunay mga kinaiya sa taas nga katukma ug epektibo nga makalikay sa pagpanghilabot sa morphology ug environmental nga mga hinungdan, sa ingon makapamubo pag-ayo sa proseso sa pagpasanay.Busa, ang SNP adunay dakong papel sa natad sa batakang panukiduki.

Ang Single Nucleotide Polymorphism (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) nagtumong sa panghitabo nga adunay usa ka nucleotide nga kalainan sa parehas nga posisyon sa DNA sequence sa mga indibidwal nga parehas o lahi nga espisye.Ang pagsal-ot, pagtangtang, pagkakabig ug pagbag-o sa usa ka base mahimong hinungdan sa kini nga kalainan.Kaniadto, ang kahulugan sa SNP lahi sa mutation.Ang usa ka variant nga locus nanginahanglan nga ang frequency sa usa sa mga alleles sa populasyon labaw pa sa 1% aron mahibal-an nga usa ka SNP locus.Bisan pa, sa pagpalapad sa modernong biolohikal nga mga teorya ug paggamit sa teknolohiya, ang frequency sa allele dili na usa ka kinahanglanon nga kondisyon aron limitahan ang kahulugan sa SNP.Sumala sa usa ka nucleotide variation data nga gilakip sa Single Nucleotide Polymorphisms (dbSNP) database ubos sa National Center for Biotechnology Information (NCBI), gilakip usab ang low-frequency insertion/deletion, microsatellite variation, ug uban pa.

SNP molekular labeling ug detection1

Sa lawas sa tawo, ang frequency sa SNP mao ang 0.1%.Sa laing pagkasulti, adunay aberids nga usa ka site sa SNP kada 1000 ka base nga pares.Bisan kung medyo taas ang frequency sa panghitabo, dili tanan nga site sa SNP mahimong mga marka sa kandidato nga may kalabotan sa mga kinaiya.Kini nag-una nga may kalabutan sa lokasyon diin nahitabo ang SNP.

Sa teoriya, ang SNP mahimong mahitabo bisan asa sa genome sequence.Ang mga SNP nga mahitabo sa rehiyon sa coding makahimo og susama nga mutasyon ug dili parehas nga mutasyon, nga mao, ang amino acid mausab o dili mausab sa wala pa ug human sa mutation.Ang giusab nga amino acid kasagarang hinungdan sa kadena sa peptide nga mawad-an sa orihinal nga function niini (missense mutation), ug mahimo usab nga hinungdan sa pag-abort sa paghubad (nonsense mutation).Ang mga SNP nga mahitabo sa non-coding nga mga rehiyon ug intergenic nga mga rehiyon mahimong makaapekto sa mRNA splicing, non-coding RNA sequence composition, ug ang binding efficiency sa transcription factor ug DNA.Ang piho nga relasyon gipakita sa numero:

Mga tipo sa SNP:

SNP molekular nga labeling ug detection2

Daghang kasagarang mga pamaagi sa pag-type sa SNP ug ang ilang pagtandi

Sumala sa lainlaing mga prinsipyo, ang sagad nga mga pamaagi sa pag-ila sa SNP gibahin sa mga musunud nga kategorya:

Klasipikasyon pagtandi sa mga pamaagi sa pag-ila

SNP molekular labeling ug detection3

Mubo nga sulat: Gilista sa lamesa ang gigamit karon nga mas komon nga mga pamaagi sa pag-detect sa SNP, ubang mga pamaagi sa pag-detect sama sa specific nga site hybridization (ASH), specific site primer extension (ASPE), single base extension (SBCE), specific site cutting (ASC), gene chip technology, mass spectrometry technology, ug uban pa wala giklasipikar ug gitandi.

Ang gasto ug oras sa pagputli sa nucleic acid sa ibabaw sa pipila ka komon nga mga pamaagi sa pag-ila sa SNP dili malikayan.Bisan pa, ang mga may kalabotan nga kit nga gibase sa direkta nga teknolohiya sa PCR sa Foregene mahimong direkta nga makahimo sa PCR o qPCR amplification sa wala pa nalimpyo nga mga sample, nga nagdala sa wala pa nakit-an nga kasayon ​​​​sa pagkakita sa SNP.

Ang direkta nga mga produkto sa serye sa PCR sa Foregene yano ug halos wala’y mga lakang sa pagputli sa sample, nga labi nga nagpamenos sa oras ug gasto nga gikinahanglan sa pag-andam sa mga template.Ang talagsaon nga Taq polymerase adunay maayo kaayo nga abilidad sa pagpadako ug makaagwanta sa lainlaing mga inhibitor gikan sa komplikado nga mga palibot sa amplification.Kini nga mga kinaiya naghatag ug teknikal nga garantiya alang sa pag-angkon ug taas nga abot nga piho nga mga produkto.Foregene Direct PCR/qPCR kits para sa nagkalain-laing matang sa sample, sama sa: mga tisyu sa mananap (ikog sa ilaga, zebrafish, ug uban pa), dahon sa tanom, mga liso (lakip ang polysaccharides ug polyphenol samples), ug uban pa.


Oras sa pag-post: Hul-23-2021