Ang tulo ka letra nga SNP kaylap sa pagtuon sa genetics sa populasyon.Dili igsapayan ang panukiduki sa sakit sa tawo, pagpoposisyon sa kinaiya sa tanum, ebolusyon sa hayop ug ekolohiya sa molekula, gikinahanglan ang mga SNP ingon sukaranan.Apan, kung wala ka'y ​​lawom nga pagsabot sa modernong genetics base sa high-throughput sequencing, ug nag-atubang niining tulo ka letra, kini daw "ang labing pamilyar nga estranghero", nan dili nimo mahimo ang sunod nga panukiduki.Busa sa dili pa magsugod sa follow-up research, atong tan-awon kon unsa ang SNP.

Ang SNP (single nucleotide polymorphism), atong makita gikan sa tibuok English nga ngalan niini, kini nagtumong sa single nucleotide variation o polymorphism.Adunay usab kini usa ka lahi nga ngalan, nga gitawag nga SNV (usa nga pagbag-o sa nucleotide).Sa pipila ka mga pagtuon sa tawo, kadtong adunay frequency sa populasyon nga mas taas sa 1% ang gitawag nga SNPs, apan sa kinatibuk-an, ang duha mahimong magkasagol.Busa makaingon kita nga ang SNP, single nucleotide polymorphism, nagtumong sa mutation diin ang usa ka nucleotide sa genome gipulihan sa laing nucleotide.Pananglitan, sa hulagway sa ubos, usa ka AT base nga pares gipulihan sa usa ka GC base nga pares, nga usa ka SNP site.

Hulagway

Bisan pa, kung kini usa ka "single nucleotide polymorphism" o usa ka "single nucleotide variation", kini medyo nagsulti, busa ang datos sa SNP nanginahanglan genome resequencing isip basihan, sa ato pa, ang sequencing data gisunod pagkahuman ang genome sa indibidwal masunud.Kung itandi sa genome, ang site nga lahi sa genome nakit-an ingon usa ka site sa SNP.

Sa termino sa mga SNP sa mga utanon,ang Plant Direct PCR kitmahimong gamiton alang sa paspas nga pagkakita.

Sa termino sa mutation type, ang SNP naglakip sa transisyon ug transversion.Ang transisyon nagtumong sa pag-ilis sa mga purine sa mga purine o mga pyrimidine sa mga pyrimidine.Ang transversion nagtumong sa us aka pagpuli sa purine ug pyrimidines.Ang kasubsob sa panghitabo magkalahi, ug ang kalagmitan sa transisyon mas taas kay sa transversion.

Sa mga termino kung diin mahitabo ang SNP, ang lainlaing mga SNP adunay lainlaing mga epekto sa genome.Ang mga SNP nga mahitabo sa intergenic nga rehiyon, nga mao, ang rehiyon tali sa mga gene sa genome, mahimong dili makaapekto sa function sa genome, ug ang mutation sa intron o sa upstream promoter nga rehiyon sa gene mahimong adunay usa ka piho nga epekto sa gene;Ang mga mutasyon nga mahitabo sa mga exon nga rehiyon sa mga gene, depende kung kini ba ang hinungdan sa mga pagbag-o sa na-encode nga mga amino acid, adunay lainlaing epekto sa mga gimbuhaton sa gene.(Siyempre, bisan kung ang duha ka SNP hinungdan sa mga kalainan sa mga amino acid, kini adunay lainlaing mga epekto sa istruktura sa protina, ug sa katapusan ang mga epekto sa biolohikal nga phenotype mahimong magkalainlain).

Bisan pa, ang gidaghanon sa mga SNP nga mahitabo sa mga lokasyon sa gene sa kasagaran mas gamay kaysa sa mga lokasyon nga dili gene, tungod kay ang usa ka SNP nga makaapekto sa function sa usa ka gene kasagaran adunay negatibo nga epekto sa pagkaluwas sa indibidwal, nga miresulta sa indibidwal nga nagdala niini nga SNP sa grupo Lakip kanila ang giwagtang.

Siyempre, alang sa diploid nga mga organismo, ang mga chromosome anaa sa mga parisan, apan imposible alang sa usa ka parisan sa mga chromosome nga magkaparehas sa matag base.Busa, ang pipila ka mga SNP makita usab nga heterozygous, nga mao, adunay duha ka base niini nga posisyon sa chromosome.Sa usa ka grupo, ang mga genotype sa SNP sa lain-laing mga indibidwal gitipon, nga nahimong basihan sa kadaghanan sa mga nagsunod nga pag-analisar.Sa kombinasyon sa mga kinaiya, mahimong hukman kung ang SNP isip usa ka molekular nga marker nalambigit sa mga kinaiya, ang QTL (quantitative trait locus) sa kinaiya mahimong mahukman, ug ang GWAS (genome-wide association study) o genetic map construction mahimong ipahigayon;Ang SNP mahimong gamiton isip molecular marker Hukmi ang ebolusyonaryong relasyon tali sa mga indibidwal;mahimo nimong i-screen ang mga functional SNP ug tun-an ang mga mutasyon nga may kalabutan sa sakit;mahimo nimong gamiton ang mga pagbag-o sa frequency sa SNP allele o heterozygous rates ug uban pang mga indicators aron mahibal-an ang pinili nga mga rehiyon sa genome ... ug uban pa, inubanan sa karon Uban sa pagpalambo sa high-throughput sequencing, gatusan ka libo o labaw pa nga mga site sa SNP mahimong makuha gikan sa usa ka set sa sequencing data.Mahimong isulti nga ang SNP nahimo na karon nga sukaranan sa panukiduki sa genetic sa populasyon.

Siyempre, ang mga pagbag-o sa mga base sa genome dili kanunay ang pagpuli sa usa ka base sa lain (bisan kung kini ang labing kasagaran).Posible usab nga usa o pipila ka base ang kulang, o duha ka base.Daghang ubang mga base ang gisal-ot sa tunga.Kining gamay nga han-ay sa mga pagsal-ot ug pagtangtang gitawag nga InDel (pagsal-ot ug pagtangtang), nga espesipikong nagtumong sa pagsal-ot ug pagtangtang sa mugbong mga tipik (usa o daghang base).Ang InDel nga mahitabo sa lokasyon sa usa ka gene mahimo usab nga adunay epekto sa function sa gene, mao nga usahay ang InDel mahimo usab nga adunay hinungdanon nga papel sa panukiduki.Apan sa kinatibuk-an, ang kahimtang sa SNP isip sukaranan sa genetics sa populasyon dili gihapon matarug.